鵺の陰陽師

幼いころから常人には見えない幻妖（げんよう）という存在が見える男子高校生、夜島学郎（やじま がくろう）はある日、人間の女性の姿をした幻妖、鵺（ぬえ）と出会う。封印されている自分に代わり幻妖を倒してほしいという鵺の提案を、父親だった夜島拓郎（やじま たくろう）を幻妖に殺されたトラウマから一度は断る学郎だったが、教室に現れた強力な幻妖に同級生の膳野忍八（ぜんの じんぱち）が命懸けで立ち向かう姿を目にして、自分も父や彼のように強くなりたいと感じる。そして自らを庇って死んだ父のように膳野を庇い致命傷を負ってしまう学郎だったが、鵺の治療によって一命を取り留め、彼女と契約を結び、幻妖を撃退する。こうして、幻妖と戦う宿命を背負うことになった学郎は、同じ学校の先輩で陰陽師の周防七咲（すおうかずさ）や二大旧家の1つ・藤乃家の陰陽師である藤乃代葉などと共にオカルト部を設立。協力して幻妖の退治に励むのだった。

藤乃家からの脱出を図る第6支部の面々。がしゃどくろの追撃に対抗するべく、遂に学郎が霊殻を発現させる!! そして、物語は新たな局面へ。鵺が「学郎の封印された令力を解く為に彼女が要る」と言い出して!?