アンダーニンジャ

太平洋戦争後、GHQによって解体された忍者組織は、紛争やテロの時代になり消滅したかに見えたが、再び多くの忍者が日本国内の官民、あらゆる組織に潜伏し、暗躍していた。その数は約20万人といわれ、忍者は現在も日本に存在している。しかし、末端の忍者によっては職にあぶれ、ニート同然の生活を送っている者もいた。その中の一人、雲隠九郎はある日、上からの指示で、最新鋭の装備と共にある高校への潜入の依頼を受ける。

楊紀伊学園の屋上では九郎と日比が山田と激突。しかし日比はあっさり敗れ、九郎が前に出る。互いに刀を持ち出し、一瞬で勝負が決まる一騎打ちが始まろうとしていた。一方、講談高校では、屋上に逃げる猿田を鬼首たちが追い詰めるが、その上空で控えていた攻撃衛星「遁」に予期せぬUN側の侵入者が現れる。また講談高校からの脱出を図る野口たちは地下の巨大空間にたどり着き、鈴木と順風耳からNINとUNの過去の因縁を聞かされるのだった。