魔法科高校の劣等生 古都内乱編

二〇九六年九月のある日、達也たちの自宅を再従姉弟の黒羽亜夜子と文弥が訪れる。彼女らが携えてきた四葉家当主・真夜からの手紙、それはパラサイドール事件の黒幕であるテロリスト・周公瑾の捕縛について達也へ協力を乞うものだった。依頼を果たすため、達也は十師族の一つ・九島家の先代当主である九島烈に面談を申し込む。それは、古くから続く魔法師たちの因縁の輪の中へと飛び込むことを意味していた――!!

「伝統派」に匿われているテロリスト・周公瑾を追う達也たちは、九島烈の協力を取り付けることに成功した。そのときに出会った九島烈の孫・光宣の案内で、達也たちは奈良に点在する「伝統派」の拠点の調査を開始する。一方、第一高校では論文コンペに向けた準備が本格化。だが慌ただしい日々の陰で、達也の友人たちを狙う者たちの姿があった......。日本の魔法師たちの因縁から生じた魔の手は、ついに達也たちの生活をも脅かす事態に――!?